Seit 2007 führte Robert Haller als Gutsdirektor den Betrieb; 2025 ist er in den Ruhestand gegangen, die Nachfolge wurde intern geregelt, neuer Gutsdirektor ist der bisherige Kellermeister Karl Brand. Das Bürgerspital wurde 1316 von Johannes und Mergardis von Steren als Spital gegründet, Im Jahr 2016 konnte man also groß feiern – 700 Jahre Bürgerspital. 1321 erhielt man durch Schenkungen die ersten Weinberge. Heute gehört das Bürgerspital zu den größten Weingütern in Deutschland. Das Gros der Weinberge, fast 80 Hektar, liegt in Würzburg. Fast 30 Hektar besitzt man im Würzburger Stein, die Einzellage Stein-Harfe im Zentrum des Steins gehört dem Bürgerspital im Alleinbesitz. Neben den Würzburger Lagen Innere Leiste, Pfaffenberg und Abtsleite erweitern Weinberge in Randersacker (Teufelskeller, Pfülben, Marsberg), Frickenhausen (Kapellenberg), in Veitshöchheim (Sonnenschein) und in Thüngersheim (Scharlachberg) das Lagenportfolio. Silvaner hat mittlerweile den Riesling als wichtigste Rebsorte überholt, nimmt knapp ein Drittel der Rebfläche ein, es folgt Riesling mit einem Anteil von 27 Prozent, dann kommen die Burgundersorten und Müller-Thurgau, dazu gibt es Scheurebe, Bacchus, Rieslaner und Gewürztraminer. An roten Sorten werden Domina, Blaufränkisch und Spätburgunder angebaut. Mit dem Jahrgang 2012 hat man das Sortiment neu strukturiert in Gutsweine, Ortsweine, Erste Lagen sowie Große Lagen und Premiumweine. Mit dem Jahrgang 2020 gab es eine Änderung: Der Würzburger Stein wird seither ausschließlich als Erste Lage genutzt, für das Große Gewächs, den bisher „Hagemann“ genannten Riesling, wird die neue Lagenbezeichnung Würzburger Stein-Berg verwendet. Die zweite signifikante Änderung ist, dass es aus jeder großen Lage nun nur noch einen Wein gibt, das heißt aus der Lage Stein-Berg gibt es nur den Riesling, dafür aus der Stein-Harfe nur noch Silvaner und keinen Riesling mehr; ein zweiter Großes Gewächs-Riesling kommt nun aus dem Pfülben. In der Vinifikation wird zunehmend mit Maischestandzeiten, Holzfassausbau und Spontangärung gearbeitet, je nach Wein und Jahrgang in unterschiedlichen Anteilen.